BLAST - компьютерлік алгоритм, оны Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығының (NCBI) веб-сайтында, сондай-ақ көптеген басқа сайттарда онлайн пайдалануға болады. BLAST сұрау ДНҚ тізбегін тізбектер дерекқорымен жылдам туралайды және салыстыра алады, бұл оны үздіксіз геномдық зерттеулерде маңызды құрал етеді.
BLAST негізгі дерекқор ма?
BLAST – биоинформатика зерттеулерінде ең көп қолданылатын бағдарламалық құрал. Оның негізгі функциясы қызығушылық тізбегін, сұрау тізбегін үлкен дерекқордағы BLAST реттіліктерімен салыстыру, содан кейін дерекқорда табылған ең жақсы сәйкестіктерді немесе «соққыларды» хабарлайды. Бұл қарапайым бағдарламаның екі негізгі қолданбасы бар.
NCBI дерекқор ма?
NCBI биотехнология мен биомедицинаға қатысты дерекқорлар сериясын қамтиды және биоинформатика құралдары мен қызметтері үшін маңызды ресурс болып табылады. Негізгі дерекқорларға ДНҚ тізбектеріне арналған GenBank және биомедициналық әдебиеттерге арналған библиографиялық деректер базасы PubMed кіреді. Басқа дерекқорларға NCBI Epigenomics дерекқоры кіреді.
BLAST тек NCBI дерекқорларында қолданылады ма?
BLAST интернетте NCBI веб-сайтында қолжетімді. Сұрау тізбегі мен мақсатты дерекқорларға сәйкес BLAST түрлерінің әртүрлі түрлері қолжетімді.
BLAST дерекқоры қалай жұмыс істейді?
BLAST қалай жұмыс істейді? BLAST эвристикалық әдіс арқылы гомологтық тізбектерді анықтайды бастапқыда екі реттілік арасындағы қысқа сәйкестіктерді табады; осылайша, әдіс барлық реттілік кеңістігін есепке алмайды. Алғашқы сәйкестіктен кейін BLAST осы бастапқы сәйкестіктерден жергілікті теңестіруді бастауға әрекеттенеді.
