BigWig - Wiggle (WIG) пішімінен түрлендіру арқылы жасалған геномдық шолғыш жолындағы тығыз, үздіксіз деректерді көрсетуге арналған файл пішімі. BigWig пішімі UCSC Genome Bioinformatics веб-сайтында сипатталған және Broad Institute файл пішімінің нұсқаулығы қосымша ақпарат береді.
BigWig пішімі дегеніміз не?
BigWig пішімі диаграмма ретінде көрсетілетін тығыз, үздіксіз деректерді көрсетуге арналған BigWig файлдары бастапқыда UCSC wigToBigWig бағдарламасы арқылы WIG түріндегі файлдардан жасалады. Немесе bigWig файлдарын bedGraph файлдарынан UCSC bedGraphToBigWig бағдарламасы арқылы жасауға болады.
BigWig файлын қалай пайдаланамын?
Жаңа жасалған bigWig файлын жылжытыңыз (myBigWig.bw) вебке қолжетімді http, https немесе ftp орнына. URL мекенжайын реттелетін жол жазбасы пішініне қойыңыз немесе бір жол сызығын пайдаланып реттелетін жолды жасаңыз. Арнаулы трек жолын реттелетін жолды басқару бетіндегі мәтін жолағына қойыңыз.
BigWig трек дегеніміз не?
bigWig тректері бүкіл геномдағы үздіксіз сигналдарға арналғанжолдар. Олар ChIP-Seq сигналдары, RNA-Seq сигналдары және т.б. сияқты әртүрлі "шикі" эксперимент нәтижелерін көрсету үшін жарамды.
BigWig файлын қалай жасауға болады?
Үлкен файлдарды жасаудың бірнеше жолы бар. Бұл әдетте түрлендіруді қамтиды. bam файлын қозғалмалы трекке (. wig), содан кейін виггль трегін екілік бигвигке түрлендіру (.
